V příběhu se stává hlavním hrdinou Tidus, slavný blitzballový hráč. Poté co je jeho rodné město zničeno obrovskou nestvůrou Sinem, je Tidus odnesen kamsik do neznáma. Seznamuje se s dívkou Yunou a přidává se k její družině, která má za úkol dostat Yunu do všech chrámů po celé zemi, za účelem naučit ji vyvolat "finálního aeona", který by možná dokázal Sina zničit....